SEQ - Plateau technique de séquençage longs fragments

Anthony Venon

Les technologies de séquençage développées par Oxford Nanopore (ONT) ont apporté une véritable révolution dans l’acquisition et l’analyse des données génétiques, permettant ainsi de mieux comprendre les bases génomiques et épigénomiques de l’adaptation des organismes à de nouveaux environnement. Le séquençage à longues lectures ONT offre aux utilisateurs un accès inégalé au génome, à l’épigénome et au transcriptome, avec une précision structurale sans précédent.

Pour prendre un premier contact, merci d’envoyer un email à : anthony.venon@inrae.fr et carine.remoue@inrae.fr

Équipements

  • Deux séquenceurs MinION
  • Séquenceur PromethION P2 Solo
  • Flongle
  • Qubit
  • Parc informatique (GPU) et serveur de stockage associé (100 To)

Comité technique

Financement

  • IDEEV
  • GQE – Le Moulon
  • AAP équipement SPS (12k euros)
  • AAP équipement Biosphera (10k euros)
  • Instruction budgétaire département INRAE BAP (5k euros)
  • AAP équipement AgroParisTech (10k euros)

Membre