Axe 3 : Comprendre et mobiliser la diversitée cultivée pour répondre aux attentes des acteurs

Nous mettons en oeuvre nos connaissances opérationnelles sur les ressources génétiques des plantes cultivées et nos compétences en méthodologie de la sélection de plantes allogames ou autogames pour répondre aux enjeux de la transition agroécologique liés à la diversification. Nos spécificités sont la maîtrise de méthodes de sélection participative, la sélection génomique, et la sélection pour la diversification (nouveaux traits, mélanges variétaux, mélanges d’espèces).

Le changement climatique, la dégradation des sols et l’utilisation de pesticides et d’engrais font peser de lourdes menaces sur la sécurité alimentaire et l’agriculture. de pesticides et d’engrais font peser de lourdes menaces sur la sécurité alimentaire et la la sécurité alimentaire et la durabilité de l’agriculture au niveau mondial. L’INRAE a révisé sa stratégie scientifique pour pour relever ces défis, en visant une transition agroécologique. GQE-Le Moulon, avec son expertise en ressources phytogénétiques et en méthodes de sélection, est en mesure de répondre à ces défis par le biais d’un programme de recherche et de développement. méthodes de sélection, est en mesure de répondre à ces défis grâce à la diversité génétique. Le troisième axe de recherche se concentre sur les méthodes de sélection innovantes et la diversification des pratiques agricoles. la diversification des pratiques agricoles impliquant des cultures telles que le blé, le maïs, des espèces sauvages telles que la Nigelle, l’orge et le maïs, le maïs, des espèces sauvages comme la Nigelle, et des espèces pérennes comme le pommier, ainsi que de nouvelles cultures intercalaires. comme les pommiers, ainsi que de nouveaux systèmes de culture intercalaire.

Ressources génétiques et méthodes de sélection innovantes

Caractérisation des ressources génétiques : Des méthodes de génotypage à haut débit ont été mises au point pour mieux caractériser les lignées consanguines et les races locales de maïs, et des efforts ont été déployés dans le cadre de projets européens pour caractériser les banques de gènes de maïs, de légumineuses et d’arbres fruitiers. Des systèmes d’information tels que Thaliadb et SHiNeMaS ont été développés pour gérer les données génétiques et tracer les lots de semences, respectivement.

Des efforts seront déployés pour détecter les régions génomiques associées à la réponse environnementale et pour comprendre l’organisation de la diversité génétique. Des caractérisations à haut débit permettront des prédictions génomiques et phénomiques pour de grandes collections.

Gestion dynamique à la ferme : L’expertise en matière de gestion dynamique de la diversité des cultures dans les exploitations agricoles a permis de créer de nouvelles variétés de population et de mettre en place des programmes de sélection participative.

Les programmes de sélection participative sur le blé se poursuivront, et des programmes similaires sont prévus pour le maïs. Les défis à relever comprennent l’évaluation des systèmes de gestion à la ferme et la mise en place de programmes de co-sélection.

Pré-breeding et sélection génomique : Des progrès ont été réalisés dans l’optimisation des cycles de sélection pré-breeding et dans la révision des schémas de sélection hybride pour le maïs. De nouveaux modèles de sélection génomique pour le blé et le maïs, ainsi que la sélection phénomique pour les cultures orphelines, ont été mis au point.

L’identification rapide des sources de diversité et leur intégration dans les programmes de sélection d’élite à l’aide des technologies génomiques sont à l’étude. Des programmes de pré-sélection sont en cours d’élaboration dans le cadre de collaborations avec des entreprises de semences.

Sélection pour la diversification

Des efforts ont été déployés pour populariser les mélanges variétaux de blé et évaluer les peuplements mixtes blé/pois et maïs/haricot. Des solutions pour gérer l’évaluation des mélanges et l’utilisation de modèles de plantes fonctionnels et structurels pour l’idéotypage des cultivars ont été développés.

Nouveaux systèmes et caractères agricoles - Transition agroécologique : De nouveaux systèmes agricoles intégrant différents leviers pour réduire les intrants industriels et évaluer de nouveaux traits pour la sélection seront développés. La recherche-action participative garantira des essais diversifiés sur le terrain.

Nouvelles variétés et nouveaux acteurs - Innovation variétale : La sélection pour la diversification impliquera la création d’hybrides complexes et de matériaux organiques hétérogènes. La sélection participative pour la gestion à la ferme des variétés populations se poursuivra.

Méthodologies

Caractérisation génomique/épigénomique : Amélioration de la caractérisation du matériel végétal hétérogène.

Installations de phénotypage : Meilleures installations pour le phénotypage de grandes collections pour différents caractères dans des conditions variables.

Modèles mathématiques et d’intelligence artificielle : Développement de modèles pour prédire les aptitudes de combinaison/mélange.

Recherche participative : Implication dans des actions de recherche participative et des approches interdisciplinaires.