logo umr
Génétique Quantitative et Évolution - Le Moulon

ABI - Atelier de Bioinformatique et Informatique

Les activités d’ABI portent sur :

  • l’analyse de la séquence des génomes
  • le développement de logiciels et bases de données pour la génétique
  • l’informatique système et réseau.
portraits des membres d'ABI

L’atelier de Bioinformatique et Informatique de GQE-Le Moulon se compose de 3 groupes :

Publications

  • Vidal A., Gauthier F. , Rodrigez W., Guiglielmoni N., Leroux D., Chevrolier N., Jasson S., Tourrette E., Martin OC., Falque M.. (2022) SeSAM: software for automatic construction of order-robust linkage maps. BMC Bioinformatics, 1 (23) 499
  • De Oliveira Y. , Burlot L., Dawson JC., Goldringer I., Madi D., Rivière P., Steinbach D., van Frank G., Thomas M.. (2020) SHiNeMaS: a web tool dedicated to seed lots history, phenotyping and cultural practices. Plant Methods, 1 (16) 98
  • Lopez Arias DC., Chastellier A., Thouroude T., Bradeen J., Van Eck L., De Oliveira Y. , Paillard S., Foucher F., Hibrand-Saint Oyant L., Soufflet-Freslon V.. (2020) Characterization of black spot resistance in diploid roses with QTL detection, meta-analysis and candidate-gene identification. Theor Appl Genet,
  • Damerval C., Citerne H., Conde E Silva N., Deveaux Y., Delannoy E., Joets J. , Simonnet F., Staedler Y., Schönenberger J., Yansouni J., Le Guilloux M., Sauquet H., Nadot S.. (2019) Unraveling the Developmental and Genetic Mechanisms Underpinning Floral Architecture in Proteaceae. Front Plant Sci, (10) 18
  • Mabire C., Duarte J., Darracq A., Pirani A., Rimbert H., Madur D., Combes V., Vitte C., Praud S., Rivière N., Joets J. , Pichon JP., Nicolas SD.. (2019) High throughput genotyping of structural variations in a complex plant genome using an original Affymetrix® axiom® array. BMC Genomics, 1 (20) 848
  • Richard MMS., Gratias A., Thareau V., Kim KD., Balzergue S., Joets J. , Jackson SA., Geffroy V.. (2018) Genomic and epigenomic immunity in common bean: the unusual features of NB-LRR gene family. DNA Res, 2 (25) 161-172
  • Ganal MW., Durstewitz G., Polley A., Bérard A., Buckler ES., Charcosset A., Clarke JD., Graner EM., Hansen M., Joets J. , Le Paslier MC., McMullen MD., Montalent P. , Rose M., Schön CC., Sun Q., Walter H., Martin OC., Falque M., Lukens L.. (2011) A Large Maize (Zea mays L.) SNP Genotyping Array: Development and Germplasm Genotyping, and Genetic Mapping to Compare with the B73 Reference Genome. PLoS ONE, 12 (6) e28334
  • Wang S., Spor A., Nidelet T., Montalent P. , Dillmann C., de Vienne D., Sicard D.. (2011) Switch between life history strategies due to changes in glycolytic enzyme gene dosage in Saccharomyces cerevisiae. Applied and environmental microbiology, 2 (77) 452-9